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基因工程實驗報告的實驗步驟
  • 發(fā)布日期:2018-02-26      瀏覽次數(shù):8353
    • 實驗一:大腸桿菌DH5α和BL21感受態(tài)細(xì)胞的制備 
      【實驗步驟】 
      1 從LB平板上挑取新活化的大腸桿菌DH5α單菌落,接種到5mL LB培養(yǎng)基中,37℃振蕩培養(yǎng)過夜。 
      2 取1mL培養(yǎng)物接種到100mL LB培養(yǎng)基(250mL三角瓶)中,37℃振蕩培養(yǎng)2~3h。 3 將菌液轉(zhuǎn)移到50mL離心管(2管)中,冰上放置15min。 4 4℃ 4000 rpm 離心5min,棄去上清液,倒置使培養(yǎng)液流盡。 
      5 用20 mL 冷CaCl2溶液懸浮菌體沉淀合并成一管,在4℃ 4000 rpm 離心5min,棄去上清液。 
      6 用10 mL 冷CaCl2溶液懸浮菌體沉淀,冰浴30min。 
      7  4℃ 4000 rpm 離心5min,棄去上清液,用2 mL的冷CaCl2溶液懸浮。 8 分裝到數(shù)個EP管中,每管200 uL,冷凍保存?zhèn)溆谩?nbsp;

       

      實驗二:目的基因質(zhì)粒(T-SOD或T-IL218) 
      和表達(dá)載體質(zhì)粒(PET32或PET30)的轉(zhuǎn)化及大量提取 
      【實驗步驟】 
      一、載體的轉(zhuǎn)化(無菌條件,冰上進(jìn)行) 1、取200 uL 新鮮制備的感受態(tài)細(xì)胞,分別加入質(zhì)粒DNA 2 uL(PET32a,IL-18),混勻,冰上放置30min。 
      2、將EP管放到42℃ 保溫90s,冰浴 2min。 
      3、加入800uL LB液體培養(yǎng)基,37℃慢搖復(fù)蘇1 h。 
      4、將100 uL 的復(fù)蘇細(xì)胞涂布在含有Amp(100mg/mL)的LB培養(yǎng)皿中,正置平皿30min(使菌液被培養(yǎng)基吸收)。 
      5、倒置平皿37℃培養(yǎng)16 h,出現(xiàn)菌落。 二、質(zhì)粒的提取 
      1 挑取單菌落接種于100 mL 加入50uL Amp 的LB液體培養(yǎng)基中,振蕩培養(yǎng)過夜。 
      2 過夜培養(yǎng)的菌液加入1.5 mL的小指管(20個每組)中,每次1 mL,4℃,12000 rpm,離心1min,4次,棄上清。 
      3 加入150uL溶液Ⅰ懸浮細(xì)胞,漩渦振蕩,室溫靜置10min。 
      4 加入350uL溶液Ⅱ(新鮮配制),輕微顛倒混勻20次,冰浴5min。(不能再劇烈震蕩) 5 加入300uL溶液Ⅲ(冰上預(yù)冷),顛倒混勻20次,不能劇烈震蕩,冰浴10min。 6 4℃,12000 rpm,離心10 min,取上清轉(zhuǎn)移至另一離心管中。 7 向上清中加入0.6倍異丙醇,輕輕混勻,室溫靜置20 min。 
      8 4℃,12000 rpm,離心10 min,棄上清,倒扣于吸水紙上,吸凈液體。 
      9 用1mL 70%乙醇洗滌質(zhì)粒DNA沉淀2次,每次4℃,12000 rpm,離心3min,吸去上清。 10 55℃烘干至無酒精,加入20uL TE,所有集成一管后加入RNase 1~2uL,37℃消化1~2h,-20℃保存。 
      11 電泳分析。制膠:0.14g瓊脂糖,20mL 1×TBE緩沖液,溶解后倒入制膠板,放入梳子,冷卻凝固待用。點樣:6uL質(zhì)粒+1uL上樣緩沖液。電壓:180V,電泳至藍(lán)色帶距離點樣孔3cm

       

      實驗三 目的基因質(zhì)粒和表達(dá)載體質(zhì)粒的酶切及其產(chǎn)物的分離純化 
      【實驗步驟】

      1 酶切

      酶切體系 

      試劑                       小量酶切                              大量酶切

      滅菌水                        5uL                                    —

      質(zhì)粒                         10uL                                  88uL

      EcoRⅠ                       0.5uL                                 1uL

      HindⅢ                       0.5uL                                 1uL

      10×Tango buffer             4uL                                   10uL

      終體積                       20uL                                  100uL

      按以上酶切體系加入0.5 mL EP管中,37℃放置3h,電泳回收片段。 (點樣:酶切體系100uL+上樣緩沖液20uL。)

      2 酶切產(chǎn)物的回收 
      1) 將單一的目的DNA條帶從瓊脂糖凝膠中切下(盡量切除多余部分放入干凈的離心管中,
      稱取重量。 
      2) 向膠塊中加入3倍體積溶膠液(如果凝膠重為0.1g,其體積可視為100uL,則加入300uL
      溶膠液),50-55℃水浴放置10min,期間不斷溫和地上下翻轉(zhuǎn)離心管,以確保膠塊充分溶解。 
      注意:溶膠時,如果溶膠液變?yōu)榧t色(正常情況下為淡黃色),可向含有DNA的膠溶液中加10-30uL 3N醋酸鈉(pH5.2)將溶液調(diào)為淡黃色,否則將會影響DNA與吸附柱的結(jié)合,影響回收效果。 
      3) 將上一步所得的溶液加入一個吸附柱中(吸附柱放入收集管中),13,000rpm 離心
      30-60s,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放入收集管中。 
      注意:膠塊*溶解后將膠溶液溫度降至室溫再上柱,因為吸附柱在較高溫度時結(jié)合DNA的能力較弱。 
      4) 向吸附柱中加入700uL漂洗液(使用前請先檢查是否已加入無水乙醇),13,000rpm 離
      心30-60s,倒掉廢液,將吸附柱重新放入收集管中。 
      5) 向吸附柱中加入500uL漂洗液,13,000rpm 離心30-60s,倒掉廢液。 
      6) 將離心吸附柱放回收集管中,13,000rpm 離心2min,盡量出去漂洗液,將吸附柱開蓋
      于室溫1-2min,*晾干,防止殘留的漂洗液影響下一步的實驗。 
      7) 將吸附柱放到一個干凈的離心管中,向吸附膜中間位置懸空滴加適量65-70℃預(yù)熱的洗
      脫液,室溫放置2min。13,000rpm 離心2min收集DNA溶液。 8) DNA產(chǎn)物-20℃保存。 
      完畢后電泳檢測回收與純化效果:DNA回收純化后,電泳檢測應(yīng)為單一的一條帶,如果切膠過程中不慎帶上染帶,回收后電泳結(jié)果可能會出現(xiàn)兩條以上的帶,這時應(yīng)重復(fù)上述方法進(jìn)行回收與純化。 

       

      實驗四 目的基因與表達(dá)載體的重組及重組子的篩選與鑒定 
      【實驗步驟】 
      1載體與目的基因的連接 
      1) 在一1.5mL EP管中加入2uL酶切后的載體DNA與6uL目的DNA片段。 2) 添加1uL的10×buffer以及1uL的T4DNA連接酶,總體積10uL。 3) 16℃水浴條件下保溫過夜連接。 2感受態(tài)細(xì)胞與連接產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化 1) 取感受態(tài)細(xì)胞BL21(實驗一制備) 200uL,加入6uL連接產(chǎn)物,輕輕用槍吹打混勻(不
      可震蕩)。 2) 冰浴30min。 
      3) 熱激:42℃保溫90S,冰浴2min。 
      4) 加入800ul  LB培養(yǎng)基,37℃慢慢復(fù)蘇30min。

      5) 將復(fù)蘇菌液4000r/min離心1min,先吸去800μL上清,再將細(xì)胞吹散成細(xì)胞懸液,取
      50μL細(xì)胞懸液直接涂布在含氨芐青霉素(Amp)100ug/ml、X-gal和IPTG的LB選擇平板上。 
      6) 將平板正向放置30min左右至液體被吸收,倒置平板37℃培養(yǎng)16—20h出現(xiàn)菌落,其
      中白色為重組質(zhì)粒。 
        3 重組子的鑒定(藍(lán)白斑篩選,小提質(zhì)粒比大小和酶切分析) 
      1)將白色單菌落接入3mL 含抗生素(Amp)的LB液體培養(yǎng)基中,37℃振蕩培養(yǎng)過夜。 2)按實驗二的方法提取質(zhì)粒DNA,20uL RTE溶解DNA沉淀。 3)雙酶切質(zhì)粒DNA 20uL 體系,方法同上。 
      4)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測重組質(zhì)粒和它的酶切產(chǎn)物。 
      (酶切鑒定重組子可見重組成功的重組子有兩個條帶:一為切為線性的PET32a質(zhì)粒條帶,一為目的基因條帶。) 
      實驗五 目的基因在大腸桿菌中的誘導(dǎo)表達(dá)及表達(dá)產(chǎn)物的SDS-PAGE分析 
      實驗I 、外源基因在大腸桿菌中的誘導(dǎo)表達(dá) 
      【實驗步驟】 
      1. 分別挑取白斑菌落(重組菌株)、藍(lán)斑菌落(非重組菌株)于5ml 含AMP的LB液體培養(yǎng)基中,37℃,190r/min振蕩培養(yǎng)過夜(注意取菌株要在超靜工作臺上操作,一定注意無菌)。 2.分別取過夜培養(yǎng)菌1ml接種到5ml含AMP的LB液體培養(yǎng)基中(藍(lán),白斑各3管,作好標(biāo)記),于37℃搖床培養(yǎng)4h左右,達(dá)到1個OD值。 
      3.因為誘導(dǎo)劑IPTG的量,誘導(dǎo)條件,誘導(dǎo)時間,培養(yǎng)基成分都可影響誘導(dǎo)表達(dá),所以可按如下6組設(shè)計培養(yǎng)

      搖瓶時間(t/h)IPTG/ul溫度T/℃ 樣液
      5732
      5737
      5742
      5732藍(lán)
      5737藍(lán)
      5742藍(lán)

      4.分別取 6支試管按上述表格控制條件,搖瓶培養(yǎng)5h。 
      5. 取1ml搖瓶后菌液于離心管,共6支,4℃低溫離心,12000 r/min,5 min,收獲菌體,棄上清,取沉淀(菌體可放-20℃存放備用)。 
      6.向每支試管沉淀均加入200μL TE液,將細(xì)胞懸浮。 
      7. 每管加入200μL  2 X SDS buffer。開水煮沸5min,再冰浴2min,4℃,12000 r/min,5 min,取上清液做凝膠電泳。

      8.觀測結(jié)果及分析(實驗Ⅱ) 

      實驗Ⅱ  SDS-PAGE檢測表達(dá)蛋白  

      【實驗步驟】

      1. 配制分離膠

      分離膠配方  

      雙蒸水   分離膠緩沖液       30%膠貯液       10%SDS        TEMED         10%AP 
      6.7ML       5ML               8ML          200μL        15μL         150μL   

      ①按要求裝好膠板 ②按比例調(diào)好分離膠,混勻后加入兩玻璃夾縫中,到上口約2cm處,并小心在膠面上加入 1cm 蒸餾水,約 40 min,等膠自然凝聚后傾斜倒,出蒸餾水,并在兩玻璃板夾縫中水平插入 1.5 mm 的梳子(在膠面上加入蒸餾水稱水封,其目的是保持膠面平整和防止空氣進(jìn)入,影響凝膠)。  
      2.按配方配制好濃縮膠 
      濃縮膠配方 雙蒸水 
      濃縮膠緩沖
      液 膠貯液 10%SDS TEMED 10%AP 6.1ML 2.5ML 1.3ML 100μL 15μL 75μL  
      混勻后加入到分離膠上,并沒過梳子,待凝固后小心撥出梳子。

      3.樣品制備 
      菌體樣品與 2×上樣緩沖液 l:1 混勻,并在 100??C 沸水浴中保溫 3-5 min,取出待用。

      4.點樣,電泳:開始電泳后,先恒壓80V,樣品進(jìn)入分離膠后恒壓120V,至電泳帶跑到前沿后停止電泳。 
      5.固定、染色、脫色:電泳完畢,將膠板從電泳槽中取出,小心從玻璃板上取下凝膠,將凝膠浸泡于染色液中染色30min左右,zui后加脫色液放到脫色搖床上脫色至區(qū)帶清晰為止。  

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